建立个体车辆的排放配额管理机制可以低成本实现道路交通行业污染物和碳排放的减排目标。这需要面向车辆个体的全域全量的动态感知、计算、决策、执行的闭环信息化体系进行支撑，而信息物理系统（cyber-physical system，CPS）技术为此提供了基础条件。但现有道路交通排放配额分配相关研究未研究车辆的污染物与碳排放的协同控制问题，忽略了车辆排放的个体排放差异性与时空动态性；交通信息物理系统相关研究缺少集成精细化的排放量化模型和排放配额管理模型。针对上述研究局限，提出了一种面向信息物理系统的个体车辆污染物与碳排放配额协同动态分配方法，构建了集成个体车辆身份识别及出行行为模型、污染物及二氧化碳排放量化模型、排放配额管理模型的交通信息物理系统框架，并提出了核心流程算法。以宣城市的真实数据进行实验分析，结果表明：提出的交通信息物理系统框架可实现个体车辆污染物和碳排放量及配额量的协同动态计算，配额分配方法与传统方法相比，配额分配颗粒度更加精细，分配对象的确定更加精准，可实现配额分配的动态调整以应对减排目标的时变性，配额分配激励先进、惩罚落后的引导效果更加显著。