基于网格区域化DBSCAN聚类的数字PCR液滴分类方法
Classification method of digital PCR droplets based on grid regional DBSCAN clustering
1. 郑州大学 信息工程学院, 郑州 450001
2. 广东顺德创新设计研究院, 广东 佛山 528311
摘要
针对数字PCR系统的配套软件缺少多重实验液滴分类功能的不足，提出了一种网格区域化DBSCAN聚类算法。首先对数据进行网格映射，建立网格索引；然后计算网格间权值并进行深度搜索扩张；最后将网格空间的聚类结果映射回数据空间。人工数据集的仿真实验表明，所提算法能够有效识别簇边缘区域且具有优良的运行效率。在此基础上，提出了基于网格区域化DBSCAN聚类的数字PCR液滴分类方法，经由对比实验及有效性测试，结果表明所提方法能够便捷、准确地进行液滴分类。可见所提方法适用于数字PCR液滴分类。
基金项目
国家教育部产学合作协同育人项目(201801158025)
出版信息
DOI: 10.19734/j.issn.1001-3695.2020.11.0371
出版期卷: 《计算机应用研究》 印刷出版, 2021年第38卷 第8期
所属栏目: 算法研究探讨
出版页码: 2365-2369
文章编号: 1001-3695(2021)08-021-2365-05
发布历史
[2021-08-05] 印刷出版
引用本文
荣章权, 廖丽敏, 张端金. 基于网格区域化DBSCAN聚类的数字PCR液滴分类方法 [J]. 计算机应用研究, 2021, 38 (8): 2365-2369. (Rong Zhangquan, Liao Limin, Zhang Duanjin. Classification method of digital PCR droplets based on grid regional DBSCAN clustering [J]. Application Research of Computers, 2021, 38 (8): 2365-2369. )
关于期刊
- 计算机应用研究 月刊
- Application Research of Computers
-
刊号
ISSN 1001-3695
CN 51-1196/TP
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