基于FCBF特征选择和集成优化学习的基因表达数据分类算法
Gene expression data classification method based on FCBF feature selection and ensemble optimized learning
深圳信息职业技术学院 数字媒体学院, 广东 深圳 518172
摘要
针对微阵列基因表达数据高维小样本、高冗余且高噪声的问题，提出一种基于FCBF特征选择和集成优化学习的分类算法FICS-EKELM。首先使用快速关联过滤方法FCBF滤除部分不相关特征和噪声，找出与类别相关性较高的特征集合；其次，运用抽样技术生成多个样本子集，在每个训练子集上利用改进乌鸦搜索算法同步实现最优特征子集选择和核极限学习机KELM分类器参数优化；然后基于基分类器构建集成分类模型对目标数据进行分类识别；此外运用多核平台多线程并行方式进一步提高算法计算效率。在六组基因数据集上的实验结果表明，该算法不仅能用较少特征基因达到较优的分类效果，并且分类结果显著高于已有和相似方法，是一种有效的高维数据分类方法。
基金项目
国家自然科学基金青年基金资助项目(61303113)
广东省自然科学基金资助项目(2016A030310072)
深圳市科技计划项目(KJYY20170724152553858)
广东省教育厅重点平台及科研项目特色创新类项目(2017GWTSCX040)
深圳市2017年度规划课题(ybzz17011,ybzz17009,zdzz17005)
校级科研课题(QN201716)
出版信息
DOI: 10.19734/j.issn.1001-3695.2018.04.0248
出版期卷: 《计算机应用研究》 印刷出版, 2019年第36卷 第10期
所属栏目: 算法研究探讨
出版页码: 2986-2991
文章编号: 1001-3695(2019)10-024-2986-06
发布历史
[2019-10-05] 印刷出版
引用本文
马超. 基于FCBF特征选择和集成优化学习的基因表达数据分类算法 [J]. 计算机应用研究, 2019, 36 (10): 2986-2991. (Ma Chao. Gene expression data classification method based on FCBF feature selection and ensemble optimized learning [J]. Application Research of Computers, 2019, 36 (10): 2986-2991. )
关于期刊
- 计算机应用研究 月刊
- Application Research of Computers
-
刊号
ISSN 1001-3695
CN 51-1196/TP
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